食品饮料净化车间隔离器提供无菌环境，保护产品使其免受来自环境和操作者的污染，免受病原微生物和变异微生物的侵害。使用隔离器意味着不用借助于传统的防腐工艺就可以生产出自然的、无防腐剂的产品，因此，质地和产品的味道都不会受影响。

在使用了食品饮料净化车间技术后，在啤酒方面，可改进感官特性，例如香气味风格和新鲜度。还可提高多数产品的稳定性，延长储存期。而用于果汁，则避免了象管道巴式消毒法那样受到长时间高温处理，因而没有造成营养损失。结果，香味、口味及颜色等感官性能都得到改善。

酿酒厂发现，为了保护其生啤酒，在填充操作中必须控制环境污染。采用食品饮料净化车间技术进行封闭式填装作业，天花板上安装HEPA过滤器，地板带孔已经成为发展趋势。传统系统中隧道式巴氏消毒法对产品进行各种高温处理，得到的产品在物理特性上发生变化。相比之下，对受控巴氏消毒法的无菌充装采用较低热处理，可在几方面改进产品的质量。

如今的酸牛奶、无菌牛奶或奶酪的加工包装中经常用到无菌处理。在需要准备许多食物的地方利用食品饮料净化车间技术是有好处的，以及必要的加热和冷藏设施。通过4个主要加热和通风系统可输送高达每分钟130,000立方英尺的过滤效率为95%的空气，每小时换气15到20次。

食品饮料净化车间窗户玻璃应使用不易碎材料。若使用普通玻璃，应采取必要的措施防止玻璃破碎后对原料、包装材料及食品造成污染。窗户如设置窗台，其结构应能避免灰尘积存且易于清洁。可开启的窗户应装有易于清洁的防虫害窗纱安装设计要求，有效防止杂物，蚊虫等污染。

食品饮料净化车间面临的食品安全隐患重重，对于食品企业参照GMP执行势在必行，也是食品企业改善环境，务求满足消费者的更高要求的工作之一。一般食品厂洁净车间可大致分为三个区域：一般作业区、准清洁区、清洁作业区。