目前,可利用的芽孢杆菌有:枯草芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌、缓慢芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、蜡样芽孢杆菌、环状芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、坚强芽孢杆菌、东洋芽孢杆菌、纳豆芽孢杆菌、芽孢乳杆菌、丁酸梭等。

枯草芽孢杆菌在代谢过程中还产生一种具有抑制或杀死它种微生物的枯草杆菌素，从而来改善水质。芽孢杆菌在繁殖过程中分泌大量的淀粉酶、蛋白酶和脂肪酶,能迅速降解鱼虾残留饵料和排泄物，在池内其他微生物的共同作用下,大部分进一步分解为水和二氧化碳,小部分成为新细胞合成的物质,从而净化水体。

枯草芽孢杆菌能大量消耗水体中的有机质，将其分解为小分子有机酸、氨基酸及氨。

枯草芽孢杆菌改善水质，为单胞藻提供营养，还可使肠道PH及氨浓度降低，净化水质。

在水体中使用枯草芽孢杆菌制剂后，对养殖水体的溶氧和PH无明显影响，但对氨氮、亚硝酸盐和硫化物均有大幅度降低。

在蟹池和鱼池中分别加入枯草芽孢杆菌作为水质改良剂发现，其对池塘氨氮、亚硝酸盐氮和硫化物有明显的降解作用。

最大降解峰值出现在3～4 d，有效时间持续超过7 天。

枯草芽孢杆菌能明显净化水质，降低虾池中的COD、亚硝酸氮和氨氮。

试验表明，只有当枯草芽孢杆菌B115浓度超过1 000 mg／kg时，可能因为菌体耗氧及培养基在水体中的氧化作用导致鱼缺氧而死。

因此，作为水质改良剂可视水质情况每7 d泼洒全池1次，使用后及时开增氧机，以保证达到最好的使用效果。

枯草芽孢杆菌作为水产微生物饲料添加剂的菌株，在生产中的应用比光合细菌、硝化细菌、乳酸菌等菌株晚。、

随着近几年在水产养殖中的应用实践，枯草芽孢杆菌类微生物饲料添加剂充分显示出以下几方面优势。

枯草芽孢杆菌稳定性好、抗性强，具有耐高温、耐酸碱、耐挤压等特点。

枯草芽孢杆菌在工业生产制粒过程中以及通过养殖动物酸性胃环境时均能保持高度稳定性。

芽孢一旦形成，便能耐受各种不利条件，如干热、湿热、紫外线、射线、强酸、强碱、有机溶剂、真空干燥、氧化作用等。

枯草芽胞杆菌的生物学性质与作用机理，枯草芽胞杆菌是一种短杆状、无荚膜能运动的革兰氏阳性细菌，能产生中生芽胞。

枯草芽胞杆菌的分布非常广泛，土壤、湖泊、海洋、动植物体表及其栖息地皆能发现。枯草芽胞杆菌能产生维生素等营养物质。

枯草芽胞杆菌在生长繁殖过程中能够产生B1 、B2、 B6等B族维生素和维生素C、维生素K2，为水产动物提供维生素营养。

枯草芽胞杆菌生命力极强，代谢旺盛，能在水体中迅速繁殖，并产生大量的胞外酶类，从而大量消耗池塘中的残饵和动物排泄物等大分子有机质。大分子有机物被分解为小分子的有机酸、氨基酸等物质。能为水体中光合细菌、藻类以及其他浮游生物提供营养，枯草芽胞杆菌使之产生良好的微生态环境。并且，芽胞杆菌适合于工业化大规模生产，技术成熟，生产稳定．产量高，周期短。尤其是芽胞的休眠体耐酸碱、耐干旱高温可以长期贮存。

枯草芽孢杆菌在水产上主要有三方面的用途

1、净化水质。枯草芽孢杆菌可以降低水体中的硝酸盐、亚硝酸盐的含量，分解养殖池中有毒有害物质，净化水质；分解池中残饵、粪便、有机物等，具有很强的清理水中垃圾小颗粒的作用；

2、抑制、杀灭致病菌。在水体或者饲料中添加枯草芽孢杆菌制剂，可以有效抑制或杀灭水体中、养殖生物体内的某些有害致病菌，并且能增强有益菌的菌群，而达到防治水产疾病的目的。芽孢杆菌还可以防止饲料发霉，防止饲料发霉产生黄曲霉毒素；

3、提高饲料转化率。枯草芽孢杆菌可产生多种酶类，饲料中添加枯草芽孢杆菌可以提高鱼虾类消化酶活性，对鱼虾肠道内营养物质消化吸收、饲料利用率有直接促进作用，饲料转化率提高可达8%以上，促进鱼虾生长。