在医药方面，水杨酸具有抗真菌、止痒及溶解角质作用。水杨酸能帮助其他抗真菌药物的穿透，并抑制细菌生长。水杨酸复配产品为目前治疗水霉病的主要药物。水杨酸类药物应复配抗病原真菌药物成分效果更理想。但是，目前市场上以水杨酸为主要成分的产品多是单一水杨酸成分，仅有脱落菌丝的作用。

鱼类水霉菌是通过菌丝体吸收营养，供自身生长发育，以孢子的形式在水中进行无性繁殖传播。水霉菌的孢子带有鞭毛，可以在水中游动。在鱼体表面出现伤口，尤其是组织坏死出现腐肉时，游动孢子就会乘机寄生，在伤口部位着生出菌丝。这些菌丝像树根一样，扎在鱼体皮肤中，向着肌肉深处生长，疯狂吸取营养，迅速生长，然后再释放出大量游动孢子，去感染其他受伤的鱼，但水霉菌不感染健康无伤的鱼。水霉病重在预防，如果真的感染了水霉病，可以用硫醚沙星全池泼洒来治疗。

水霉菌感染初期 ，如果是外伤引起，大多是赤皮病并发水霉病，菌丝主要向内生长，深入伤口的肌肉中，因此肉眼看不到鱼有明显变化。随着菌丝不断增生，分泌出蛋白分解酶，分解鱼肌肉中的蛋白质，作为自身生长的营养。之后吸收了鱼体大量营养物质的菌丝，才开始向外生长，在伤口周围形成肉眼可见的棉絮状外菌丝。到了这个阶段，基本也就到了水霉病的中晚期了，这个阶段在低温时节水霉菌有时“隐藏”一两月之久才显现。菌丝和鱼伤口组织粘连在一起，鱼体组织进一步坏死，造成鱼游动失常，食欲不振或拒食，身体消瘦，最终会因多器官衰竭而死亡。