当中央空调循环水系统长期运转后，生物粘泥严重，在决定停车清洗前，首先对中央空调整个系统进行一次杀菌粘泥剥离清洗，然后打开冷凝器，根据中央空调清洗的效果再决定对主要换热器进行机械与酸洗相结合的单台冷凝器、蒸发器清洗方案。粘泥剥离清洗是针对系统中的生物粘泥严重，采取杀菌和分散剥离的办法，将生物粘泥先行清洗剥离掉。清洗剥离时间，一般为1-2天，在循环水中投加大剂量的GJ-1B高效杀菌粘泥剥离剂、分散剂、渗透剂。第3天排污。如此经过反复循环、杀菌剥离粘泥和分散清洗，基本上可以洗去生物黏泥，但对硬垢和锈瘤的清洗效果差，故中央空调水系统经过清洗剥离后，仍需对冷凝器、蒸发器进行单台的机械清洗和酸洗才行。

在中央空调清洗之后，必须仔细检查设备，查看设备上是否有残留铜附着于管子而未清洗掉。因为不同金属之间存着电位差，铜的存在将使铜铁腐蚀加速。中央空调清洗后，在冷却水和冷冻水系统中按工艺要求分别投加中央空调水处理药剂以减缓重新结垢，并使中央空调清洗后的金属表面形成防腐蚀的膜层。

中央空调循环水系统的预膜是为了提高中央空调水处理缓蚀剂的成膜效果，常在中央空调循环水开车初期投加较高的缓蚀剂量，待成膜后，再降低药剂浓度维持补膜，即所谓的正常处理。这种预膜处理，其目的是希望在中央空调水系统金属表面上能很快地形成一层保护膜，提高缓蚀剂抑制腐蚀的效果。实践也证明在同一个系统中，经过预膜和未经预膜的设备，在用同样的缓蚀剂情况下，其缓蚀效果却相差很大。因此，中央空调循环水开车初期的预膜工作必须要给以高度重视。