目前,可利用的芽孢杆菌有:枯草芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌、缓慢芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、蜡样芽孢杆菌、环状芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、坚强芽孢杆菌、东洋芽孢杆菌、纳豆芽孢杆菌、芽孢乳杆菌、丁酸梭等。

枯草芽孢杆菌能大量消耗水体中的有机质，将其分解为小分子有机酸、氨基酸及氨。

枯草芽孢杆菌改善水质，为单胞藻提供营养，还可使肠道PH及氨浓度降低，净化水质。

在水体中使用枯草芽孢杆菌制剂后，对养殖水体的溶氧和PH无明显影响，但对氨氮、亚硝酸盐和硫化物均有大幅度降低。

在蟹池和鱼池中分别加入枯草芽孢杆菌作为水质改良剂发现，其对池塘氨氮、亚硝酸盐氮和硫化物有明显的降解作用。

最大降解峰值出现在3～4 d，有效时间持续超过7 天。

枯草芽孢杆菌能明显净化水质，降低虾池中的COD、亚硝酸氮和氨氮。

试验表明，只有当枯草芽孢杆菌B115浓度超过1 000 mg／kg时，可能因为菌体耗氧及培养基在水体中的氧化作用导致鱼缺氧而死。

因此，作为水质改良剂可视水质情况每7 d泼洒全池1次，使用后及时开增氧机，以保证达到最好的使用效果。

枯草芽孢杆菌在水产养殖中能大量消耗水体中的有机质，将其分解为小分子有机酸改善水质，为单胞藻提供营养。抑制有害藻类及病原微生物繁殖，增加水体活力。同时能降解有毒物质，净化养殖环境。但在使用过程中需要注意以下下几个事项：

1.使用时不要与消毒及抗菌药物一起使用，养殖水处理时注意增氧。

2.枯草芽孢杆菌的用量并非越多效果就越好，适当添加可以增加水体活力，保证养殖动物的正常活动，过量使用却会导致水体缺氧。

3.枯草芽孢杆菌并不能对所有病害起到防治作用，平时要密切关注水体状况和养殖动物的活动情况，加强日常管理。

4.枯草芽孢杆菌使用前最好先活化，然后再使用。这是因为芽孢杆菌粉剂中的芽孢一般以芽孢和营养体两种形式存在，活化是为了让芽孢休眠体快速萌发为营养体，同时促进细菌增殖，提高活菌数。一般建议用30℃左右的温水加红糖活化2、3小时。这样活化后的枯草芽孢投入水体后能迅速增殖，分解大量有机质。