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由此构成的蛋白多糖聚合体曲折盘绕，形成多微孔的筛状结构，称为 分子筛。分子筛只允许小于其微孔的物质通过，对大于其微孔的大分子物质、细菌等则具有屏障作用。使基质成为限制细菌等有害物质扩散的防御屏障。溶血性链球菌和癌细胞等能产生透明质酸酶，分解蛋白多糖，破坏基质结构，得以扩散。蛋白多糖聚合体上还结合着许多亲水基团，能结合大量水分子，形成细胞外“储水库”。
分子筛又称沸石，它在自然界里就存在，但目前在工业上用的大多是人工合成的。在外观上，分子筛是粉末状的固体，有光泽，天然沸石有颜色，合成沸石一般呈白色。在化学结构上，分子筛是一种结晶型的硅铝酸盐，其晶体结构中具有许多空穴，空穴之间有孔道(又称窗口)相连，凡直径比孔径小的“瘦”分子可以通过窗口进入空穴，而直径大于孔径的“胖”分子就只能被挡在窗口外面“望筛兴叹”。
按催化性质，分子筛催化剂：
(1) 酸催化剂，利用分子筛的表面酸性进行催化反应。
(2)双功能催化剂，分子筛可以负载铂、钯类的金属，得到兼有金属催化功能和酸催化功能的双功能分子筛催化剂。
(3) 择形催化剂，由于分子筛的催化作用一般发生在晶体内空间，分子筛的孔径大小和孔道结构对催化活性和选择性有很大的影响。分子筛具有规整而均匀的晶内孔道，而且孔径大小接近于分子尺寸，使分子筛的催化性能随反应物分子、产物分子或反应中间物的几何尺寸的变化而显著变化。
