认证工厂自认证合约签约日起，应确实依据「食品GMP追踪管理要点」（PMCC-之规定接受追踪查验，如有异常情形时，由认证执行机构通知限期改善。经认证执行机构以书面通知限期改善无效时，得报请推行委员会取消该认证工厂或产品之食品GMP认证资格，并由推广宣导执行机构通知终止合约书。

认证工厂依本规章相关规定接受产品检验时应缴费，并于收到专业执行机构缴费通知后一个月内缴清。逾期未缴者，经再限期催缴（每次催缴期间为一个月），且于十二个月内累计催缴纪录达三次者，得由专业执行机构报请推行委员会取消该工厂之食品GMP认证资格及认证标志使用权。

认证工厂经认证执行机构报请推行委员会取消工厂或产品之认证资格及认证标志使用权后，若仍继续使用时，应由认证执行机构确认后报请推行委员会透过大众传播媒体公布布厂商名称，并由推行委员会函请相关主管机关依法办理。

GMP要求在机构、人员、厂房、设施设备、卫生、验证、文件、生产管理、质量管理、产品销售与回收、投诉与不良反应、自检等方面都必须制订系统的、规范化的规程。

GMP的中心指导思想是：食品质量是在生产过程中形成的，而不是检验出来的。因此必须强调预防为主，在生产过程中建立质量保证体系，实行全面质量保证，确保食品质量。

GMP是食品生产质量全面管理控制的准则，它的内容可以概括为硬件、软件和人员。所谓GMP的硬件是指厂房与设施、设备等方面的规定；软件是指组织、规程、操作、卫生、记录、标准等管理规定；人员是指相关岗位需要合适的人员。GMP也是国际性食品生产质量控制和检查的依据，已成为国际公认和通行的从事食品生产所必须遵循的基本准则。