深圳进出口报关货物许可证是国家管理货物出境的法律凭证。进出口许可证，包括法律、行政法规规定的各种具有许可进口或出口性质的证明、文件。需要注意的是，向海关提交的许可证并不是一直固定不变的，国家主管部门随时会调整发布，所以需要时刻留意。国家出入境检验检疫局与海关总署从2000年1月1日起实施新的检验检疫货物通关制度，通关模式为“先报验，后报关”。同时出入境检验检疫部门将启用新的印、证书。
对于一般深圳进出口报关货物，在发货人或其代理人如实向海关申报，并如数缴纳应缴税款和有关规费后，海关在出口装货单上盖"海关放行章"出口货物的发货人凭以装船起运出境。出口货物的退关:申请退关货物发货人应当在退关之日起三天内向海关申报退关,经海关核准后方能将货物运出海关监管场所。
查验是指海关在接受报关单位的申报并已经审核的申报单位为依据，通过对深圳进出口报关货物进行实际的核查，以确定其报关单证申报的内容是否与实际进出口的货物相符的一种监管方式。1.通过核对实际货物与报关单证来验证申报环节所申报的内容与查证的单、货是否一致，通过实际的查验发现申报审单环节所不能发现的有无瞒报、伪报和申报不实等问题。2.通过查验可以验证申报审单环节提出的疑点，为征税、统计和后续管理提供可靠的监管依据。海关查验货物后，均要填写一份验货记录。
申报应注意的问题：报关时限:报关时限是指货物运到口岸后,法律规定发货人或其代理人向海关报关的时间限制。出口货物的报关时限限为装货的24小时以前。不需要征税费、查验的货物，自接受申报起1日内办结通关手续。
当海关报关系统接收到后会交由审单中心负责处理深圳各个口岸传输的报关数据，目前出口商品绝大多数是由电脑自动审单，只要发送到审单中心，就会自动通过，报关公司在发送前必须严格审核所申报的资料与客户提供的内容完全一致。审核通过后，打印出口报关单后，连同报关资料(核销单、合同、发票等)，报关员签字、报关公司盖章，向现场海关递单。首先递单给综合科，综合科在电脑里确认接单，需要征税的货物转给税费组，一般货物转交给风险管理科，风险管理科认为需要查验的货物进行电脑布控，不要查验的货物直接放行，转交给放行组加盖海关印章后出单给报关行。
报关行将放行条交给码头进行电脑确认海关是否放行，确认后加盖码头确认章，再由报关行将放行条交给船代公司，船代公司根据放行条装船出口。当船离开港口后，船代公司会在电脑发送一份此船实际装船的舱单资料给海关的报关电脑系统，报关电脑系统与舱单资料对碰一致后才可以向海关申请打印出口外汇核销联及退税联。至此，全部报关环节完毕。
当深圳进出口报关货柜进入码头堆场后，码头电脑会纪录此货柜的进场时间、柜号、封条号、堆场位置等信息，并通过与海关电脑联网受到海关电脑的监控。此时才可以正式向海关申报出口。首先由深圳进出口报关公司通过联网电脑向船代根据客户提供资料输入要报关的船名、航次、柜号、订舱号、出口单位名称、收货人名称、货物名称、件数、毛重等资料。船代收到资料并审核通过后会自动向海关电脑传输资料。(只有个别驳船公司需要船代公司负责审核上述内容，防止爆舱情况，一般船代在这里是不会每份具体审核的)。海关电脑收到资料后也会自动通过，因此所有上述资料是由深圳进出口报关公司根据客户提供的内容并且负责审核的。
当海关电脑通过后，打印在空白装船单上，(此时叫做装船单(D/O)，当海关电脑予以放行并且加盖海关印章后，就叫做“放行条”。)报关公司将装船单上的内容(主要是16位数的运输工具号码及10位数的提运单号码)，通过海关允许的录入公司，正式向海关的报关电脑系统申报出口(请注意，海关只承认当海关的电脑报关系统接收到申报时的时间为报关时间，之前这么多环节只算是准备环节，因此海关要求的“提前24小时申报”指的是在某条船截关前的24小时要向海关报关电脑系统申报，当然这个要求不太实际，因为有时路途运输问题、货物生产时间问题、报关资料交接问题等都有可能导致赶船的情况出现，最常见的信用证马上到期，货物刚刚好才生产出来，运到码头时当天就要截关。
