食品饮料净化车间最好能与外界隔离，不能穿行或受其他因素干扰。食品/饮料无菌洁净车间的大小依需要而定，一般由更衣间、缓冲间、风淋室和操作间组成。更衣间放在外，主要供更换衣帽、鞋子等;缓冲间位于更衣间与风淋室之间，也可同时和几个操作间相通;操作间放在内间，主要供产品灌装，房间应不受日光直射，大小适当，高度适宜(具体根据生产设备的高度确定)。食品饮料净化车间实验室的人流经过更衣室更衣换鞋→清洗间洗手→缓冲间→风淋室→各操作室。食品/饮料无菌洁净车间物流由外走廊经过机械连锁自消毒传递窗消毒后进入缓冲走廊后再经过传递窗进入各操作室。

食品饮料净化车间隔离器提供无菌环境，保护产品使其免受来自环境和操作者的污染，免受病原微生物和变异微生物的侵害。使用隔离器意味着不用借助于传统的防腐工艺就可以生产出自然的、无防腐剂的产品，因此，质地和产品的味道都不会受影响。

糖果工业采用了食品饮料净化车间技术。新的、越来越复杂的、包装新颖的糖果产品增加了对受控环境的需求(温度、湿度、细菌的水平，等等)，以及生产过程的自动化，以便保证良好品质和耐久性。半导体工业和医药工业已经越来越多地使用隔离器以提供ISO 4级(10级)或者更好的局部环境。

在使用了食品饮料净化车间技术后，在啤酒方面，可改进感官特性，例如香气味风格和新鲜度。还可提高多数产品的稳定性，延长储存期。而用于果汁，则避免了象管道巴式消毒法那样受到长时间高温处理，因而没有造成营养损失。结果，香味、口味及颜色等感官性能都得到改善。

如今的酸牛奶、无菌牛奶或奶酪的加工包装中经常用到无菌处理。在需要准备许多食物的地方利用食品饮料净化车间技术是有好处的，以及必要的加热和冷藏设施。通过4个主要加热和通风系统可输送高达每分钟130,000立方英尺的过滤效率为95%的空气，每小时换气15到20次。

净化车间可以影响产品的品质，例如光感应胶片、电子器件、实验试剂、精密电子仪表和微型电机等产品，要是被粉尘污染，就会降低产品质量乃至报废。在食品加工业中，食品饮料净化车间如果存在微生物会减短保质期，降低产品品质。

食品饮料净化车间的好坏会影响生产效率：一方面，优良的环境不仅可以保障生产加工人员的身心健康，而且可以提高他们的工作心情和工作激情;另一方面，优良的环境可以确保生产的顺利开展，提升产品的合格率。